![]() |
![]() |
|
GAUSSIAN 03, GAUSSIAN 09
Obliczenia mogą być prowadzone na układach w stanie gazowym lub roztworach, w stanie podstawowym lub stanie wzbudzonym. Gaussian jest potężnym narzędziem do analizy wpływu podstawników, badania mechanizmów reakcji, obliczeń powierzchni energii potecjalnej i energii wzbudzenia.
Aktualnie w Cyfronecie została zainstalowana nowa wersja pakietu Gaussian - g09.
Szereg przykładowych plików danych, dostępny jest w katalogu: na komputerze baribal - /opt/gaussian03/g03/tests/com UWAGA! Aby móc korzystać z Gaussiana 03 lub z Gaussiana 09 trzeba być wpisanym do grupy g03. W tym celu należy się skontaktować z administratorem oprogramowania.
Administrator oprogramowania GAUSSIAN:
Maria.Wielgus tel. 632-33-55 wew.308 1. jeżeli pracujemy w shellu tcsh, to należy wykona ć następujące polecenia: setenv g09root /opt/gaussian09
2. jeżeli pracujemy w shellu bash (shell defaultowy), to należy wykonać następujące polecenia: g09root=/opt/gaussian09
W obu shellach Gaussian wywolywany jest komenda: g09 plik-wejsciowy gdzie plik-wejsciowy jest nazwa pliku z danymi z rozszerzeniem .com
Sposób użycia Gaussiana 03 (na komputerze baribal): 1. jeżeli pracujemy w shellu tcsh, to należy wykonać następujące polecenia: setenv g03root /opt/gaussian03 2. jeżeli pracujemy w shellu bash (shell defaultowy), to należy wykonać następujące polecenia: g03root=/opt/gaussian03
W obu shellach Gaussian wywoływany jest komendą: g03 plik-wejsciowy gdzie plik-wejsciowy jest nazwą pliku z danymi z rozszerzeniem .com np.: Komenda g03 woda.com lub g03 woda
powoduje przeczytanie danych z pliku woda.com i rozpoczęcie obliczeń, wyniki zapisywane są na pliku woda.log Przy dłuższych obliczeniach należy zadanie umieścić w kolejce.
W trakcie wykonania zadania sa tworzone pliki robocze o nazwach Gau-nr_zadania z
różnymi rozszerzeniami, które zwykle po pomyślnym
zakończeniu zadania są usuwane. Pliki te są dosyć obszerne i mogą się nie mieścić w katalogu użytkownika, co może być przyczyną przerwania obliczeń. Dlatego też zalecane jest wskazanie katalogu np. /scratch dla plików roboczych. Katalog roboczy można określić definiując zmienną systemową GAUSS_SCRDIR np. przy pomocy komendy setenv : setenv GAUSS_SCRDIR /scratch gdzie /scratch jest katalogiem przeznaczonym do zapisu plików roboczych.
Maria.Wielgus@cyfronet.krakow.pl |
![]() | Powrót | ![]() | Indeks | ![]() | Komunikaty | ![]() | Webmaster | ![]() | Do góry | ![]() | Serwis Akademicki | ![]() | Kraków i okolice |